地球进入了创世纪的0011年，人类却失去了2/3的人口，究其原因，还是因为11年前的那场大异变------南极的冰水融化了，被认为在1万2千年前就应该灭亡的阿托兰迪亚又得到复苏，被称为有着双翼的堕天翅族他们向人类居住的城市不断地派出生物机械兵器神话兽去捕获人类，为的就是获取一种名为普拉纳的生物体能量。 另一方面，人类也在策划着反击，他们从海底遗迹中发掘出3架混合战斗机Vector Machine。它们是在1万2千年前将堕天翅族灭亡的传说中的兵器。只要3架战斗机合体的话，就将变成威力强大的机械天使阿克艾里欧。 要想驾驭阿克艾里欧。就必须要求驾驶员拥有能够与机械生命产生感应，共鸣的特殊元素，也就是特殊体制的人类。而且因为要求有特别敏锐的五感和纯净的灵魂，于是召集了翼披只有10来岁左右的少男少女来作为飞行员的人选。 终于，机械天使阿克艾里欧合体的时刻来到了……
