桐人、尤吉歐、愛麗絲距離兩名修劍士和一名整合騎士打敗了最高祭司阿多米尼斯多雷特已過去了半年。結束了戰鬥後，愛麗絲在故鄉盧利特村生活。在她的身旁，是失去了摯友，自己也失去了手臂和心的桐人。獻身般支撐著他的愛麗絲，絲毫沒有保留像以前一樣作為騎士的心。『告訴我，桐人.....我到底該怎麼辦.....』然而，讓整個Under World陷入悲劇《最終負荷實驗》的倒數計時，卻毫不留情地推進著。彷彿與之相呼應一般，在《黑暗領域》的深處，暗黑神・貝庫達已經復活了。他率領暗黑帝國的軍隊，為了奪取《光之巫女》，開始入侵了《人界》。指揮“人界”軍隊的貝爾庫利等人決心與《黑暗領域》的軍隊展開前所未有的大戰。但在身邊，依舊看不到愛麗絲以及拯救了《人界》的兩位英雄的身影—『SAO』系列中最長最唯美的戰鬥，《Alicization》篇的最終章即將開始!
