倾心于天文研究的兜甲儿自美国NASA留学归国，来到宇门源藏博士创办的宇宙科学研究所见习协助研究，并藉此结识了茂才特立的所长养子宇门大介伴随着曾出不穷的不明飞行物体出现，月亮在夜晚中产生被染成红色的异象，处心积虑企图征服全宇宙的‘贝加星联合军’（ベガ星连合军），将魔爪伸往地球再掀新的战端，以月球背面作为据点举军率领大量飞碟及‘飞碟兽’（円盘兽）、‘贝加兽’（ベガ兽） 进行侵略战争。有着一段不为人知的惨痛过去的弗利特星王子宇门大介，为了不让所热爱的第二故乡重蹈覆辙，毅然地再度挺身而出驾驶古兰戴萨（グレンダイザー），恢复“杜克‧弗利特”（デューク‧フリード）之名誓死赌上自身性命，与甲儿一同保护这片绿意盎然的大地。
